Es war Sant Kirpal Singh ein besonderes Anliegen, bedürftigen Menschen mit medizinischer Versorgung zu helfen, und so war es 1983 das Krankenhaus, das als erste Einrichtung innerhalb des Projekts die Arbeit aufnahm.

Neben der Schulmedizin werden auch Homöopathie und Behandlungsmethoden des Ayurveda eingesetzt.

Im Krankenhaus erhalten Bedürftige kostenlose ärztliche Behandlung und Medikamente. Die Mehrzahl der Patienten wird derzeit noch ambulant behandelt. Außerdem werden entfernt gelegene Orte mit dem Ambulanzbus angefahren, um an Sammelpunkten wie Schulen u. dgl. Patienten zu versorgen, die sonst keine Möglichkeit haben, einen Arzt zu besuchen. Von Zeit zu Zeit führen Fachärzte im Kirpal Charitable Hospital Augenoperationen durch. Eine Zahnarztpraxis betreut neben der Bevölkerung aus der Umgebung auch die Schüler der Academy. Die Studenten des zukünftigen Medical College werden im Krankenhaus ihre praktische Ausbildung erhalten. In diesem Rahmen ist auch ein Austausch mit Ärzten und Studenten aus dem Westen geplant.